滇龙胆GrHMA基因的克隆和原核表达
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摘要:HMA蛋白(heavy metal transporting ATPase)是一种在植物中广泛存在的多功能蛋白。根据滇龙胆转录组GrHMA基因序列,设计特异性引物,通过RT-PCR扩增GrHMA基因序列,并进行TA克隆、测序及序列分析;构建原核表达载体pGEX-4T-1-GrHMA,转入E.coli Rosetta(DE3)中,并在37℃、1.Ommol/L IPTG下成功诱导表达。序列分析表明,GrHMA基因是HMA超家族的成员;GrHMA氨基酸序列系统发育分析表明,CrHMA与TcHMA处于同一进化枝。SDS-PAGE结果表明所表达蛋白与预期蛋白大小一致。这些结果为GrHMA蛋白的进一步纯化及结构和功能的研究奠定基础。
关键词:滇龙胆;GrHMA基因;克隆;原核表达
中图分类号:Q786
文献标识码:A
文章编号:1007-7847(2014)03-0211-07
滇龙胆(Gentiana rigescens)为龙胆科(Gen-tianaceae)龙胆属多年生宿根草本植物,是我国特有物种,主要分布于云南、贵州、四川、广西等省,其中云南是主要产区。野外主要生长在海拔1100~3000m杂木林下、荒坡地、山谷灌木丛旁[1]。滇龙胆在云南有悠久的药用历史[2],被《中国药典》2010年版收录,为传统中药材龙胆的植物主要来源之一[3]。目前,国内外对滇龙胆的研究主要集中在栽培、农艺性状、化学成分研究、矿质元素测定等方面[4-6],而对滇龙胆的重金属转运蛋白及其逆境胁迫和抗性研究未见报道。
重金属ATP酶(heavy metal transporting AT-Pase,HMA),又称为P1B-ATPase,其能选择性地运输Cu+、Cu2+、Zn2+和CO2+等必须的金属离子,还能转运Cu2+、Cd22+和Pb2+等重金属离子[7];因其含有一个保守的内膜基序(CPx:Cys-Pro-Cys/His/Ser),又称为CPx-ATPase[8,9]。植物HMA除参与重金属离子的稳态外,还涉及植物对重金属的吸收、转运、解毒和富集等方面[10,ll]。HMA基因在植物中广泛存在,如在低等植物绿藻(Chlamydomonas rein-hardtii)中克隆到3个基因(CrHMA1~3),红藻(Cyanidioschizon merolae)中克隆到2个基因(CmHMA1,CmHMA2)。单子叶植物水稻(Oryzasativa)基因组中发现9个HMA基因(OsHMAl~9),大麦(Hordei vulgaris)中有10个HMA基因(HvHMAl-HvHMA10)[11~13]。于拟南芥(Arabidop-sis thaliana)中克隆到8个HMA基因(AtHMA l~8) [12,14],大豆(Glycine max)基因组中发现9个HMA基因(GmHMAl~GmHMA9)[15]。此外,Southron、Pa-poyan等16,17]从甘蓝型油菜(Brassica napus)克隆到了P1B-ATPase基因BnRANl(HMA7);Courbot等[18]从重金属Zn/Cd超富集植物鼠耳芥(Arabidopsishaller)中克隆到AhHMA4;Cobbett、Bernard等[8,19]从遏蓝菜(Thlaspi caerulescens)中克隆到TcHMA4基因。植物基因组中有多个HMA基因存在,其蛋白在植物的根、茎、叶和细胞中的叶绿体、内质网、高尔基体、液泡和质膜上均有定位[20]。根据重金属的底物特异性可以将P1B-ATPase分为两个亚类:Zn2+/CO2+/Cd2+/Pb2+P1B-ATPase(Zn亚类)和Cu+/Ag+P1B-ATPase(Cu亚类),其中动物只有Cu亚类[11,21]。植物中则包含这两个亚类,如拟南芥AtHMAl-4属于Zn亚类,而AtHMA5-8属于Cu亚类[21];水稻OsHMAl-OsHMA3属于Zn亚类,OsHMA4-OsHMA9属于Cu亚类[13]。
虽然HMA蛋白在植物中广泛分布,但目前的研究仍仅局限于拟南芥,在重金属超富集植物中没有进行系统全面的研究,而在药用植物滇龙胆中至今未有报道。本研究根据3年生滇龙胆的转录组中GrHMA基因序列设计特异性引物,从滇龙胆幼叶中提取RNA,反转录为cDNA,进而扩增到GrHMA基因序列,并进行TA克隆、测序和序列分析;构建GrHMA基因原核表达载体,在大肠杆菌Rosetta中进行表达,使用SDS-PAGE检测其蛋白表达情况。结果显示GrHMA基因为HMA基因家族的成员,在37℃、1.0mmol/L IPTG诱导下成功表达,这将为滇龙胆GrHMA蛋白的纯化、结构和功能研究奠定基础,也为植物、动物、微生物中HMA的研究提供参考。
1材料与方法
1.1植物材料
供试材料滇龙胆(Gentiana rigescens Franch.ex Hemsl.)种植于云南省农科院药用植物研究所种质资源圃(25°08"04.50"N,102°46"15.05"E)。栽培地海拔1942m,年平均气温14.7℃,年平均降水量980~1050mm,极端高温30.4℃,极端低温-0.2℃。试验材料为滇龙胆长势良好的幼叶。
1.2菌株、载体、酶等主要试剂
工程菌E.coli Trans 5α、E.coli Rosetta(DE3)、RNAiso for Polysaccharide-rich Plant Tissue Reagent、反转录试剂盒、限制性内切酶BamH I和Xho I及异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、X-gal等均购买于宝生物工程(大连)有限公司;高纯质粒小量制备试剂盒(离心柱型)、多功能DNA纯化回收试剂盒均购自北京百泰克生物技术有限公司;质粒pGEX-4T-l由玉溪师范学院分子生物学实验室保存;引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成,测序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
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